Verbesserte genomweite Assoziationen bei Verwendung eines rassespezifischen 200K SNP-Chips für Deutsche Schwarzbunte Niederungsrinder (DSN)

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In dieser Studie haben wir GWAS mit 2.099 DSN-Rindern und 20 Milchleistungsmerkmalen unter Verwendung von 131.273 SNPs vom DSN200K-Chip durchgeführt. Wir verglichen diese Ergebnisse mit den Ergebnissen, die mit dem Illumina 50K-Chip und in silico zufällig generierten SNP-Chips mit der gleichen Anzahl von SNPs wie der ursprüngliche DSN200K-Chip erzielt wurden. Dadurch testeten wir, ob nur die Anzahl der SNPs oder auch die Auswahl der SNPs auf dem DSN200K-Chip die GWAS-Ergebnisse verbesserten.