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Verbesserte genomweite Assoziationen bei Verwendung eines rassespezifischen 200K SNP-Chips für Deutsche Schwarzbunte Niederungsrinder (DSN)

Korkuc, Paula; Neumann, Guilherme B.; Arends, Danny; Wolf, Manuel J.; May, Katharina; König, Sven and Brockmann, Gudrun A. (2022) Verbesserte genomweite Assoziationen bei Verwendung eines rassespezifischen 200K SNP-Chips für Deutsche Schwarzbunte Niederungsrinder (DSN). Paper at: Vortragstagung der DGfZ und GfT, Kiel, Deutschland, 21.-22.09.2022. [Completed]

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Summary

In dieser Studie haben wir GWAS mit 2.099 DSN-Rindern und 20 Milchleistungsmerkmalen unter Verwendung von 131.273 SNPs vom DSN200K-Chip durchgeführt. Wir verglichen diese Ergebnisse mit den Ergebnissen, die mit dem Illumina 50K-Chip und in silico zufällig generierten SNP-Chips mit der gleichen Anzahl von SNPs wie der ursprüngliche DSN200K-Chip erzielt wurden. Dadurch testeten wir, ob nur die Anzahl der SNPs oder auch die Auswahl der SNPs auf dem DSN200K-Chip die GWAS-Ergebnisse verbesserten.


EPrint Type:Conference paper, poster, etc.
Type of presentation:Paper
Keywords:BLE, BÖL, BOEL, FKZ 15NA010, DSN – Deutsches Schwarzbuntes Niederungsrind, Milchvieh, Doppelnutzungsrind, Genreserve, Erhaltungszucht, Genetische Marker
Agrovoc keywords:
Language
Value
URI
English
cattle
http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_1391
English
genotypes
http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_3225
English
genetic markers
http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_24030
Subjects: Animal husbandry > Production systems > Dairy cattle
Animal husbandry > Production systems > Beef cattle
Animal husbandry > Breeding and genetics
Research affiliation: Germany > Federal Organic Farming Scheme - BOEL > Animals > Tierzucht
Germany > University of Berlin - HU
Related Links:https://www.bundesprogramm.de, https://orgprints.org/id/eprint/30261/, https://www.ble.de/DE/Projektfoerderung/projektfoerderung_node.html
Deposited By: Korkuc, Dr. Paula
ID Code:52443
Deposited On:19 Jan 2024 10:31
Last Modified:19 Jan 2024 13:58
Document Language:German/Deutsch
Status:Unpublished
Refereed:Peer-reviewed and accepted
Additional Publishing Information:Gefördert durch das Bundesministerium für Ernährung und Landwirtschaft aufgrund eines Beschlusses des Deutschen Bundestages im Rahmen des Bundesprogramms Ökologischer Landbau und andere Formen nachhaltiger Landwirtschaft.

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