Optimierung des Kompostmikrobioms gegen bodenbürtige Krankheiten mittels Diagnostik und Antagonisten

Summary

Der Einsatz von suppressivem Kompost kann Verluste durch bodenbürtige Krankheiten reduzieren. Die Schwierigkeit ist die Variabilität dieser Suppressivität. Dieses Projekt hatte zum Ziel, mittels mikrobieller Marker die Suppressivität von Kompost zu diagnostizieren, ausgewählte Mikroorganismen gezielt zu isolieren, deren Funktion zu untersuchen sowie die Suppressivität von Komposten zu verbessern.
Hauptresultate:
• Bakterien- und Pilzgemeinschaften von 37 Komposten und den zugehörigen Rhizoplanen wurden sequenziert und mit Suppressivität korreliert. Mehrere für Suppressivität indikative mikrobielle Taxa wurden identifiziert.
• Mehrere gemäss Sequenzierdaten interessante Gattungen wurden isoliert und in vitro (Einzelstämme, Plattenhemmtests) oder in vivo (Konsortien, Topfversuche) auf Aktivität getestet, wobei spezifische Konsortien Aktivität zeigten.
• Verschiedenste Ansätze zur Entwicklung eines Diagnostiktools wurden verfolgt, waren aber nicht erfolgreich.
Fazit und Ausblick
• Unser Projekt leistet einen wichtigen Beitrag zum Verständnis der krankheitsunterdrückenden Wirkung von Komposten.
• Die Kombination der generierten Daten mit neuen molekularen Methoden für die zusätzliche Erfassung der Funktionalitäten wird es in Zukunft erlauben, weitere Fortschritte beim Verständnis von komplexen mikrobiellen Gemeinschaften und deren Funktionen zu erzielen und wird die gezielte Nutzung und Herstellung von suppressiven Komposten ermöglichen.