Steinhauer, Diana and Lücke, Friedrich-Karl (2008) Molekulare Muster der bakteriellen Besiedelung von Möhren aus ökologischer und konventioneller Erzeugung. [Molecular patterns of bacterial colonization of carrots from organic and conventional horticulture.] Gesunde Pflanzen, 60, pp. 111-120.
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Um festzustellen, wie sich unterschiedliche Anbauformen auf die bakterielle Besiedlung von Möhren auswirken, wurde Erntegut aus definierter Erzeugung bis zu sieben Monate gelagert (5°C, 95% relative Feuchte) und die bakterielle Flora auf der Oberfläche mit Hilfe DNA-basierter Fingerprint-Methoden charakterisiert. Während der Lagerung verdarben vier von 34 Möhrenvarianten sichtbar durch Pilze, davon zwei Proben von Möhren aus ökologischem Anbau, die experimentell im Rahmen eines Feldversuchs mit organischem Stickstoff „überdüngt“ worden waren. Die Fingerprint-Methoden SSCP (Single Strand Conformation Polymorphism) und ARDRA (Amplified Ribosomal DNA Restriction Analysis) weisen Unterschiede in der ribosomalen RNA nach und erfassten Unterschiede in der Zusammensetzung der Bakterienflora sowie deren Verschiebung während der Lagerung von Möhren. Deutliche Effekte der Anbauform gab es nicht. Die T-RFLP(Terminal Restriction Fragment Length Polymorphism)-Methode, eine Weiterentwicklung der ARDRA, erfasste Unterschiede in der Bakterienbesiedlung bei Möhrenproben mit sichtbarem Verderb.
Summary translation
In order to assess the effects of different cropping systems on the bacterial flora, we stored 34 batches of carrots of defined origin for extended periods at 5°C and high relative humidity and characterised the pattern of the bacterial flora by using DNA-based fingerprint methods. Four of these batches were spoiled by fungi. Of these, two were from a field experiment where organically grown carrots received additional organic nitrogen. Other effects of the cropping method (organic vs. conventional) were not observed. The „fingerprint methods“ SSCP and ARDRA detect differences in the ribosomal RNA. Using them, we found differences in the composition of the bacterial flora of carrots of different origin, and detected shifts of this flora during storage. No clear correlations with the cropping method were found. T-RFLP (a method based on the ARDRA principle) showed differences in the bacterial flora of visibly spoiled carrots.
| EPrint Type: | Journal paper |
|---|---|
| Keywords: | Genetische Fingerabdrücke - Bakterienbesiedlung - Möhren - Ökologischer und konventioneller Anbau - 03OE191 - BÖL - BOEL |
| Subjects: | Crop husbandry > Post harvest management and techniques |
| Research affiliation: | Germany > Federal Organic Farming Scheme - BOEL > Food > Quality |
| Related Links: | http://bundesprogramm-oekolandbau.de, http://bundesprogramm.de/fkz=03OE191, http://orgprints.org/perl/search/advanced?addtitle%2Ftitle=&keywords=03OE191&projects=BOEL&_order=bypublication&_action_search=Suchen |
| Deposited By: | Lücke, Dr Friedrich-Karl |
| ID Code: | 14953 |
| Deposited On: | 15 Dec 2008 |
| Last Modified: | 12 Apr 2010 07:38 |
| Document Language: | German/Deutsch |
| Status: | Published |
| Refereed: | Peer-reviewed and accepted |
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